Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK0

Ripk4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk4Q9ERK0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ripk4Q9ERK0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ripk4Q9ERK0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms