Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE8

Tlnrd1, Talin rod domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlnrd1Q9ERE8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tlnrd1Q9ERE8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms