Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slco1c1Q9ERB5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slco1c1Q9ERB5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slco1c1Q9ERB5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slco1c1Q9ERB5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slco1c1Q9ERB5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slco1c1Q9ERB5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slco1c1Q9ERB5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slco1c1Q9ERB5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Slco1c1Q9ERB5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Slco1c1Q9ERB5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slco1c1Q9ERB5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slco1c1Q9ERB5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms