Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhox9Q9EQM5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhox9Q9EQM5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhox9Q9EQM5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhox9Q9EQM5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhox9Q9EQM5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhox9Q9EQM5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhox9Q9EQM5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhox9Q9EQM5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhox9Q9EQM5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhox9Q9EQM5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhox9Q9EQM5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhox9Q9EQM5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhox9Q9EQM5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhox9Q9EQM5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhox9Q9EQM5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhox9Q9EQM5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhox9Q9EQM5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhox9Q9EQM5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhox9Q9EQM5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhox9Q9EQM5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhox9Q9EQM5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhox9Q9EQM5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhox9Q9EQM5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhox9Q9EQM5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhox9Q9EQM5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhox9Q9EQM5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhox9Q9EQM5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhox9Q9EQM5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhox9Q9EQM5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox9Q9EQM5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms