Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPS6

Vmn1r171, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r171Q9EPS6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r171Q9EPS6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r171Q9EPS6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r171Q9EPS6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r171Q9EPS6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r171Q9EPS6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r171Q9EPS6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r171Q9EPS6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r171Q9EPS6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r171Q9EPS6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r171Q9EPS6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r171Q9EPS6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r171Q9EPS6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r171Q9EPS6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r171Q9EPS6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r171Q9EPS6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r171Q9EPS6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r171Q9EPS6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r171Q9EPS6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r171Q9EPS6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r171Q9EPS6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r171Q9EPS6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r171Q9EPS6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r171Q9EPS6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r171Q9EPS6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r171Q9EPS6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r171Q9EPS6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r171Q9EPS6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r171Q9EPS6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r171Q9EPS6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r171Q9EPS6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r171Q9EPS6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r171Q9EPS6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r171Q9EPS6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r171Q9EPS6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r171Q9EPS6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r171Q9EPS6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r171Q9EPS6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r171Q9EPS6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r171Q9EPS6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r171Q9EPS6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r171Q9EPS6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r171Q9EPS6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r171Q9EPS6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r171Q9EPS6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r171Q9EPS6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r171Q9EPS6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r171Q9EPS6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r171Q9EPS6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r171Q9EPS6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r171Q9EPS6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r171Q9EPS6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r171Q9EPS6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r171Q9EPS6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r171Q9EPS6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r171Q9EPS6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r171Q9EPS6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r171Q9EPS6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r171Q9EPS6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r171Q9EPS6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r171Q9EPS6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r171Q9EPS6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r171Q9EPS6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r171Q9EPS6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r171Q9EPS6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r171Q9EPS6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r171Q9EPS6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r171Q9EPS6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r171Q9EPS6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r171Q9EPS6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r171Q9EPS6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r171Q9EPS6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r171Q9EPS6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r171Q9EPS6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r171Q9EPS6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r171Q9EPS6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r171Q9EPS6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r171Q9EPS6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r171Q9EPS6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r171Q9EPS6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r171Q9EPS6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r171Q9EPS6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r171Q9EPS6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r171Q9EPS6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r171Q9EPS6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r171Q9EPS6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r171Q9EPS6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r171Q9EPS6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r171Q9EPS6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r171Q9EPS6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r171Q9EPS6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r171Q9EPS6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r171Q9EPS6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r171Q9EPS6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r171Q9EPS6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r171Q9EPS6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r171Q9EPS6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r171Q9EPS6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r171Q9EPS6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r171Q9EPS6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms