Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL6

Mmp1b, Interstitial collagenase B, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp1bQ9EPL6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp1bQ9EPL6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms