Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP93

Vmn1r53, Vomeronasal type-1 receptor 53, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r53Q9EP93 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r53Q9EP93 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r53Q9EP93 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r53Q9EP93 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r53Q9EP93 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r53Q9EP93 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r53Q9EP93 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r53Q9EP93 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r53Q9EP93 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r53Q9EP93 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r53Q9EP93 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r53Q9EP93 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r53Q9EP93 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r53Q9EP93 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r53Q9EP93 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r53Q9EP93 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r53Q9EP93 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r53Q9EP93 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r53Q9EP93 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r53Q9EP93 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r53Q9EP93 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r53Q9EP93 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r53Q9EP93 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r53Q9EP93 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r53Q9EP93 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r53Q9EP93 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r53Q9EP93 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r53Q9EP93 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r53Q9EP93 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r53Q9EP93 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r53Q9EP93 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r53Q9EP93 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r53Q9EP93 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r53Q9EP93 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r53Q9EP93 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r53Q9EP93 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r53Q9EP93 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r53Q9EP93 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r53Q9EP93 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r53Q9EP93 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r53Q9EP93 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r53Q9EP93 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r53Q9EP93 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r53Q9EP93 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms