Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT5

Sdf2, Stromal cell-derived factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdf2Q9DCT5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdf2Q9DCT5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdf2Q9DCT5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdf2Q9DCT5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdf2Q9DCT5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdf2Q9DCT5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdf2Q9DCT5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdf2Q9DCT5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdf2Q9DCT5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdf2Q9DCT5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdf2Q9DCT5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdf2Q9DCT5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdf2Q9DCT5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdf2Q9DCT5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdf2Q9DCT5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdf2Q9DCT5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdf2Q9DCT5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdf2Q9DCT5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdf2Q9DCT5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdf2Q9DCT5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdf2Q9DCT5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdf2Q9DCT5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdf2Q9DCT5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdf2Q9DCT5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdf2Q9DCT5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdf2Q9DCT5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdf2Q9DCT5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdf2Q9DCT5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdf2Q9DCT5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdf2Q9DCT5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdf2Q9DCT5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdf2Q9DCT5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdf2Q9DCT5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdf2Q9DCT5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdf2Q9DCT5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdf2Q9DCT5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdf2Q9DCT5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms