Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trmt112Q9DCG9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trmt112Q9DCG9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms