Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Xab2Q9DCD2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Xab2Q9DCD2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms