Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syde1Q9DBZ9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms