Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cbx6Q9DBY5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms