Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAP7

Asf1b, Histone chaperone ASF1B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1bQ9DAP7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Asf1bQ9DAP7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Asf1bQ9DAP7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms