Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samd8Q9DA37 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms