Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp12Q9D9M2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp12Q9D9M2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms