Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9I4

Tbc1d20, TBC1 domain family member 20, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d20Q9D9I4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tbc1d20Q9D9I4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tbc1d20Q9D9I4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tbc1d20Q9D9I4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tbc1d20Q9D9I4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms