Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D8N1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D8N1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D8N1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D8N1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D8N1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 265.6 ms