Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Jam3Q9D8B7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jam3Q9D8B7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms