Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp4bQ9D8B3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms