Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2af1Q9D883 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
U2af1Q9D883 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
U2af1Q9D883 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms