Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fip1l1Q9D824 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Fip1l1Q9D824 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms