Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp4cQ9D7F7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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