Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tube1Q9D6T1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tube1Q9D6T1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tube1Q9D6T1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tube1Q9D6T1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tube1Q9D6T1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tube1Q9D6T1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tube1Q9D6T1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tube1Q9D6T1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tube1Q9D6T1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tube1Q9D6T1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tube1Q9D6T1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tube1Q9D6T1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tube1Q9D6T1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tube1Q9D6T1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tube1Q9D6T1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tube1Q9D6T1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tube1Q9D6T1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tube1Q9D6T1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tube1Q9D6T1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tube1Q9D6T1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Tube1Q9D6T1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tube1Q9D6T1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms