Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23bQ9D662 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23bQ9D662 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23bQ9D662 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23bQ9D662 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23bQ9D662 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec23bQ9D662 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec23bQ9D662 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec23bQ9D662 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec23bQ9D662 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec23bQ9D662 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec23bQ9D662 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec23bQ9D662 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec23bQ9D662 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms