Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.7
Rab11fip1Q9D620 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Rab11fip1Q9D620 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rab11fip1Q9D620 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rab11fip1Q9D620 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Rab11fip1Q9D620 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rab11fip1Q9D620 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Rab11fip1Q9D620 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Rab11fip1Q9D620 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rab11fip1Q9D620 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rab11fip1Q9D620 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rab11fip1Q9D620 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Rab11fip1Q9D620 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Rab11fip1Q9D620 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rab11fip1Q9D620 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rab11fip1Q9D620 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Rab11fip1Q9D620 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Rab11fip1Q9D620 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rab11fip1Q9D620 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rab11fip1Q9D620 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rab11fip1Q9D620 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rab11fip1Q9D620 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rab11fip1Q9D620 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rab11fip1Q9D620 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rab11fip1Q9D620 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rab11fip1Q9D620 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rab11fip1Q9D620 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rab11fip1Q9D620 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Rab11fip1Q9D620 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rab11fip1Q9D620 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rab11fip1Q9D620 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Rab11fip1Q9D620 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rab11fip1Q9D620 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rab11fip1Q9D620 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rab11fip1Q9D620 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rab11fip1Q9D620 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rab11fip1Q9D620 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Rab11fip1Q9D620 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rab11fip1Q9D620 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rab11fip1Q9D620 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rab11fip1Q9D620 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rab11fip1Q9D620 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rab11fip1Q9D620 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rab11fip1Q9D620 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rab11fip1Q9D620 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rab11fip1Q9D620 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rab11fip1Q9D620 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rab11fip1Q9D620 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rab11fip1Q9D620 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rab11fip1Q9D620 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Rab11fip1Q9D620 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rab11fip1Q9D620 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rab11fip1Q9D620 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rab11fip1Q9D620 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rab11fip1Q9D620 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms