Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc81Q9D5W4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc81Q9D5W4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc81Q9D5W4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc81Q9D5W4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc81Q9D5W4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc81Q9D5W4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc81Q9D5W4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc81Q9D5W4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc81Q9D5W4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc81Q9D5W4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc81Q9D5W4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc81Q9D5W4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc81Q9D5W4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc81Q9D5W4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc81Q9D5W4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc81Q9D5W4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc81Q9D5W4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc81Q9D5W4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc81Q9D5W4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc81Q9D5W4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc81Q9D5W4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc81Q9D5W4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc81Q9D5W4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc81Q9D5W4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc81Q9D5W4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc81Q9D5W4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc81Q9D5W4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc81Q9D5W4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc81Q9D5W4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc81Q9D5W4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc81Q9D5W4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc81Q9D5W4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc81Q9D5W4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc81Q9D5W4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc81Q9D5W4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc81Q9D5W4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc81Q9D5W4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc81Q9D5W4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc81Q9D5W4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc81Q9D5W4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc81Q9D5W4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc81Q9D5W4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc81Q9D5W4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc81Q9D5W4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc81Q9D5W4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc81Q9D5W4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc81Q9D5W4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc81Q9D5W4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc81Q9D5W4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc81Q9D5W4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc81Q9D5W4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc81Q9D5W4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc81Q9D5W4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc81Q9D5W4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc81Q9D5W4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc81Q9D5W4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc81Q9D5W4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc81Q9D5W4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc81Q9D5W4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc81Q9D5W4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc81Q9D5W4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc81Q9D5W4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc81Q9D5W4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc81Q9D5W4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc81Q9D5W4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc81Q9D5W4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc81Q9D5W4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc81Q9D5W4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc81Q9D5W4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc81Q9D5W4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc81Q9D5W4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc81Q9D5W4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc81Q9D5W4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc81Q9D5W4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc81Q9D5W4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc81Q9D5W4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc81Q9D5W4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc81Q9D5W4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc81Q9D5W4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc81Q9D5W4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc81Q9D5W4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc81Q9D5W4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc81Q9D5W4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc81Q9D5W4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc81Q9D5W4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc81Q9D5W4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc81Q9D5W4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc81Q9D5W4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc81Q9D5W4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc81Q9D5W4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc81Q9D5W4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc81Q9D5W4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc81Q9D5W4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc81Q9D5W4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc81Q9D5W4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc81Q9D5W4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc81Q9D5W4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc81Q9D5W4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc81Q9D5W4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms