Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Speer4f1Q9D5Q6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Speer4f1Q9D5Q6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Speer4f1Q9D5Q6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Speer4f1Q9D5Q6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Speer4f1Q9D5Q6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Speer4f1Q9D5Q6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Speer4f1Q9D5Q6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Speer4f1Q9D5Q6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Speer4f1Q9D5Q6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Speer4f1Q9D5Q6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Speer4f1Q9D5Q6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Speer4f1Q9D5Q6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Speer4f1Q9D5Q6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer4f1Q9D5Q6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer4f1Q9D5Q6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer4f1Q9D5Q6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer4f1Q9D5Q6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer4f1Q9D5Q6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer4f1Q9D5Q6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer4f1Q9D5Q6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer4f1Q9D5Q6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer4f1Q9D5Q6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer4f1Q9D5Q6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer4f1Q9D5Q6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer4f1Q9D5Q6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Speer4f1Q9D5Q6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Speer4f1Q9D5Q6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Speer4f1Q9D5Q6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Speer4f1Q9D5Q6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Speer4f1Q9D5Q6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Speer4f1Q9D5Q6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Speer4f1Q9D5Q6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Speer4f1Q9D5Q6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Speer4f1Q9D5Q6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Speer4f1Q9D5Q6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Speer4f1Q9D5Q6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Speer4f1Q9D5Q6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Speer4f1Q9D5Q6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Speer4f1Q9D5Q6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Speer4f1Q9D5Q6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Speer4f1Q9D5Q6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Speer4f1Q9D5Q6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Speer4f1Q9D5Q6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Speer4f1Q9D5Q6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms