Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc130Q9D516 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms