Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf6Q9D4J7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Phf6Q9D4J7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf6Q9D4J7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms