Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gcc1Q9D4H2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gcc1Q9D4H2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gcc1Q9D4H2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms