Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C1

Lmntd1, Lamin tail domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd1Q9D4C1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmntd1Q9D4C1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lmntd1Q9D4C1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lmntd1Q9D4C1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmntd1Q9D4C1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmntd1Q9D4C1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmntd1Q9D4C1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmntd1Q9D4C1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmntd1Q9D4C1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmntd1Q9D4C1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmntd1Q9D4C1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmntd1Q9D4C1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmntd1Q9D4C1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmntd1Q9D4C1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmntd1Q9D4C1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmntd1Q9D4C1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmntd1Q9D4C1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmntd1Q9D4C1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmntd1Q9D4C1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmntd1Q9D4C1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms