Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sohlh2Q9D489 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sohlh2Q9D489 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sohlh2Q9D489 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sohlh2Q9D489 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sohlh2Q9D489 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sohlh2Q9D489 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sohlh2Q9D489 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sohlh2Q9D489 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sohlh2Q9D489 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sohlh2Q9D489 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sohlh2Q9D489 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sohlh2Q9D489 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sohlh2Q9D489 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sohlh2Q9D489 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sohlh2Q9D489 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sohlh2Q9D489 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sohlh2Q9D489 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sohlh2Q9D489 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sohlh2Q9D489 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sohlh2Q9D489 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sohlh2Q9D489 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sohlh2Q9D489 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sohlh2Q9D489 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sohlh2Q9D489 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sohlh2Q9D489 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sohlh2Q9D489 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sohlh2Q9D489 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sohlh2Q9D489 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sohlh2Q9D489 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sohlh2Q9D489 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sohlh2Q9D489 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sohlh2Q9D489 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sohlh2Q9D489 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sohlh2Q9D489 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sohlh2Q9D489 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sohlh2Q9D489 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sohlh2Q9D489 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sohlh2Q9D489 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms