Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4933428M09RikQ9D3X3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4933428M09RikQ9D3X3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms