Protein–RNA interactions for Protein: Q9D275

Batf3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Batf3Q9D275 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Batf3Q9D275 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Batf3Q9D275 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Batf3Q9D275 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Batf3Q9D275 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Batf3Q9D275 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Batf3Q9D275 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Batf3Q9D275 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Batf3Q9D275 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Batf3Q9D275 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Batf3Q9D275 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Batf3Q9D275 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Batf3Q9D275 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Batf3Q9D275 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Batf3Q9D275 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Batf3Q9D275 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Batf3Q9D275 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms