Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nol3Q9D1X0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nol3Q9D1X0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms