Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1G1

Rab1b, Ras-related protein Rab-1B, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1bQ9D1G1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab1bQ9D1G1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab1bQ9D1G1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab1bQ9D1G1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab1bQ9D1G1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab1bQ9D1G1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab1bQ9D1G1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab1bQ9D1G1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab1bQ9D1G1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab1bQ9D1G1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab1bQ9D1G1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab1bQ9D1G1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab1bQ9D1G1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab1bQ9D1G1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab1bQ9D1G1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab1bQ9D1G1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab1bQ9D1G1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab1bQ9D1G1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab1bQ9D1G1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab1bQ9D1G1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab1bQ9D1G1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab1bQ9D1G1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab1bQ9D1G1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab1bQ9D1G1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab1bQ9D1G1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab1bQ9D1G1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab1bQ9D1G1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab1bQ9D1G1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab1bQ9D1G1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab1bQ9D1G1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab1bQ9D1G1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab1bQ9D1G1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab1bQ9D1G1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab1bQ9D1G1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab1bQ9D1G1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab1bQ9D1G1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab1bQ9D1G1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab1bQ9D1G1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab1bQ9D1G1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab1bQ9D1G1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab1bQ9D1G1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab1bQ9D1G1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab1bQ9D1G1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab1bQ9D1G1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab1bQ9D1G1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab1bQ9D1G1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab1bQ9D1G1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab1bQ9D1G1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab1bQ9D1G1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab1bQ9D1G1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab1bQ9D1G1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab1bQ9D1G1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab1bQ9D1G1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab1bQ9D1G1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab1bQ9D1G1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms