Protein–RNA interactions for Protein: Q9D067

Mdm1, Nuclear protein MDM1, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm1Q9D067 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mdm1Q9D067 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mdm1Q9D067 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mdm1Q9D067 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mdm1Q9D067 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mdm1Q9D067 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mdm1Q9D067 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Mdm1Q9D067 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mdm1Q9D067 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mdm1Q9D067 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mdm1Q9D067 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mdm1Q9D067 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mdm1Q9D067 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mdm1Q9D067 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mdm1Q9D067 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mdm1Q9D067 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mdm1Q9D067 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mdm1Q9D067 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mdm1Q9D067 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms