Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Utp11Q9CZJ1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Utp11Q9CZJ1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms