Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nde1Q9CZA6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nde1Q9CZA6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms