Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrs1Q9CYH6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrs1Q9CYH6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrs1Q9CYH6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrs1Q9CYH6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrs1Q9CYH6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrs1Q9CYH6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrs1Q9CYH6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrs1Q9CYH6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrs1Q9CYH6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrs1Q9CYH6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrs1Q9CYH6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrs1Q9CYH6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrs1Q9CYH6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrs1Q9CYH6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrs1Q9CYH6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrs1Q9CYH6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrs1Q9CYH6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrs1Q9CYH6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrs1Q9CYH6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrs1Q9CYH6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrs1Q9CYH6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrs1Q9CYH6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrs1Q9CYH6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrs1Q9CYH6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrs1Q9CYH6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrs1Q9CYH6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrs1Q9CYH6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrs1Q9CYH6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrs1Q9CYH6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrs1Q9CYH6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrs1Q9CYH6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrs1Q9CYH6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrs1Q9CYH6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrs1Q9CYH6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrs1Q9CYH6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrs1Q9CYH6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrs1Q9CYH6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rrs1Q9CYH6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rrs1Q9CYH6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rrs1Q9CYH6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrs1Q9CYH6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms