Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssu72Q9CY97 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssu72Q9CY97 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms