Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Mis12Q9CY25 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mis12Q9CY25 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms