Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nip7Q9CXK8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nip7Q9CXK8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms