Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmed5Q9CXE7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms