Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Prdm5Q9CXE0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm5Q9CXE0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms