Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RpainQ9CWY9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms