Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cxxc1Q9CWW7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms