Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdca4Q9CWM2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdca4Q9CWM2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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