Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
BccipQ9CWI3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BccipQ9CWI3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BccipQ9CWI3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BccipQ9CWI3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BccipQ9CWI3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BccipQ9CWI3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
BccipQ9CWI3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BccipQ9CWI3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BccipQ9CWI3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BccipQ9CWI3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BccipQ9CWI3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BccipQ9CWI3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms