Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp13a2Q9CTG6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp13a2Q9CTG6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms